Depremler neticesinde Likya’nın önemli ticari merkezlerinin sular altında kalmasıyla oluşan Batık Şehir, Kekova’nın en gizemli ve korunması gereken bölgesidir. Kekova Adası'nın kıyısı boyunca uzanan bu su altı kalıntılarında, merdivenler, ev duvarları, dükkan kalıntıları ve eski liman yapıları suyun altından size göz kırpar. Koruma altındaki sit alanı olduğu için bu bölgede yüzmek ve demirlemek kesinlikle yasaktır.
Ziyaretçiler bu büyüleyici alanı genellikle altı cam olan teknelerle, yavaşça süzülerek seyrederler. Suyun üzerindeki ev kalıntılarının suyun altına doğru nasıl devam ettiğini izlemek, zamanın akışına ve doğanın gücüne karşı derin bir hayranlık uyandırır. Burası, Akdeniz'in sularına gömülmüş bir zaman kapsülü gibidir.
